《重庆理工大学学报（自然科学）》创刊于1987年12月，原名为《教学与研究》，当时主管单位是中国兵器工业总公司，主办单位是重庆工业管理学院（即重庆理工大学前身）；1994年初获得国家科委（国科通[1994]5号文）正式批准为国内外公开发行，刊名变更为《重庆工业管理学院学报》。1999年经重庆市教委批准刊名变更为《重庆工学院学报》，主管单位由中国兵器工业总公司变更为重庆市教育委员会，主办单位仍然为重庆工学院。2009年10月经国家新闻出版总署批准(新出审字［2009］407号)，《重庆工学院学报》更名为《重庆理工大学学报》。《重庆理工大学学报（自然科学）》以车辆工程、机械与材料、数理化科学、电子与自动化技术、计算机与信息科学技术、生物工程、基础科学研究等为主要内容的综合性学术期刊。     

本刊融合古今，汇聚中外，集学术性、知识性、实用性于一体，理论联系实际，贴近车辆、机电工程技术实践和计算机与信息科学技术发展的实际，重点刊登有创造性、探索性、开拓性的学术论文、科研成果报告、主要学术问题的评述和学科前沿的综述，在全国高校学报这块园地中拥有了自己的一席之地。主要栏目有:车辆工程、机械与材料、数理化科学、电子与自动化、计算机与信息技术、生物工程等。本刊坚持以“车辆工程”、“生物工程”为特色栏目，以“机械与材料”、“计算机与信息技术”、“电子与自动化”、“数理化科学”等为主体栏目，其中“车辆工程”栏目特邀中国汽车研究院副总工程师、中国汽车工程学会委员、资深车辆工程领域专家郭正康教授为栏目主持人，新打造的“车辆工程”栏目获得广泛赞誉；“生物工程”栏目特邀重庆理工大学化学与生物工程学院院长全学军教授为栏目主持人，栏目设置特色鲜明、重点突出，学术文章原创性强。在2007年刊发的文章中，国家级基金文章达87篇，省部级基金文章达212篇，教授文章56篇，副教授、博士文章105篇。在2008年刊发的文章中，国家级基金文章91篇，省部级基金文章212篇，基金比达67.73%，产生了良好的社会和经济效益。

 在23年的办刊过程中，我刊刊登了来自全国各地，乃至世界一些国家的稿件，作者遍布国内31个省、市、自治区、直辖市，而且有来自韩国、瑞典等国外高校的优质稿源，年发稿总数占收稿总数的比例为29.65%。本刊被美国《化学文摘》(CA)、英国《科学文摘》（SA，INSPEC）、美国《乌利希国际期刊指南》（UlrichIPD）、中国科技论文统计源、数学文摘、中国物理文摘、中国学术期刊综合评价数据库（CAJCED）、中国期刊网、中国学术期刊（光盘版）、中文科技期刊数据库（CJFD）、中国核心期刊（遴选）数据库、中国物理学文摘数据库、等数据库和文摘收录。

在《中国学术期刊综合引证年度报告》（2007年版）中《重庆理工大学学报（自然科学）》总被引频次539次。在新发布的《中国学术期刊综合引证年度报告》（2008年版）中《重庆理工大学学报（自然科学）》总被引频次1406次、在全国高校学报自然科学专业类期刊中排名第20，影响因子0.823、在全国高校学报自然科学专业类期刊中排名第10。

 在长期的办刊实践中，《重庆理工大学学报（自然科学）》屡获殊荣：2001年荣获“全国首届《CAJ-CD规范》执行优秀奖期刊，并成为中国学术期刊综合评价数据库来源期刊，以及《中国期刊网》、《中国学术期刊（光盘版）》、《中文科技期刊数据库》全文收录期刊。在历届由重庆市新闻出版局、重庆市科委举办的“好稿评选”活动中，我刊推荐的稿件获奖率均为100%。在重庆市2007年期刊综合质量考评中，我刊更是以93.4分的优异成绩获“重庆市一级期刊” 殊荣，在132家期刊中排名第15位，全市各类期刊仅43家被评为“重庆市一级期刊”。2008年6月，被收录为《中国科技论文统计源期刊》（中国科技核心期刊），成功跨入1700种“中国科技核心期刊”行列。2008年，在由重庆市教育委员会组织开展的第一届重庆市高校期刊先进集体、优秀编辑工作者、优秀编辑学论著的评选中，我刊期刊社荣获“重庆市高校期刊先进集体”光荣称号。